Protein–RNA interactions for Protein: Q8K368

Fanci, Fanconi anemia group I protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanciQ8K368 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FanciQ8K368 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms