Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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