Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef8Q8CE24 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms