Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

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Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lrrc9Q8CDN9 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc9Q8CDN9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Lrrc9Q8CDN9 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Lrrc9Q8CDN9 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Lrrc9Q8CDN9 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Lrrc9Q8CDN9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Lrrc9Q8CDN9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Lrrc9Q8CDN9 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc9Q8CDN9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms