Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms