Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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