Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms