Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Zbtb40Q6PCS8 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Zbtb40Q6PCS8 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbtb40Q6PCS8 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms