Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg9aQ68FE2 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms