Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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AtrxQ61687 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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