Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Sidt2-202ENSMUST00000114573 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Urb1Q571H0 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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