Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms