Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms