Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm21454-201ENSMUST00000178599 1285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Sh2d1a-207ENSMUST00000189753 1223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 AC123692.1-201ENSMUST00000227514 730 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Spred1-202ENSMUST00000110901 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf166Q3U9F6 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.3 ms