Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Nt5c1b-217ENSMUST00000219826 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Acot11-201ENSMUST00000065253 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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