Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim71Q1PSW8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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