Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Perm1Q149B8 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms