Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Sh3bp2Q06649 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sh3bp2Q06649 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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