Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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