Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms