Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms