Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms