Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tra2bP62996 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms