Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LmnaP48678 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms