Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VdrP48281 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
VdrP48281 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
VdrP48281 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms