Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Grik2P39087 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms