Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PpargP37238 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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PpargP37238 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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PpargP37238 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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PpargP37238 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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PpargP37238 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PpargP37238 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PpargP37238 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PpargP37238 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PpargP37238 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PpargP37238 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PpargP37238 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PpargP37238 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PpargP37238 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PpargP37238 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PpargP37238 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms