Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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