Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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PdgfraP26618 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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PdgfraP26618 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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PdgfraP26618 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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PdgfraP26618 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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PdgfraP26618 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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PdgfraP26618 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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PdgfraP26618 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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