Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Tsta3P23591 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Tsta3P23591 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Tsta3P23591 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Tsta3P23591 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Tsta3P23591 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tsta3P23591 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms