Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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