Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P20040 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms