Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irf1P15314 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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