Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.1 ms