Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Vmn1r209-201ENSMUST00000095961 939 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Tnip3-207ENSMUST00000212375 1543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lhx8O35652 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms