Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms