Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn34c3J3QJW5 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn34c3J3QJW5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms