Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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