Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Phf11bB4XVQ1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms