Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms