Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cpne6Q9Z140 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms