Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms