Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm43135-201ENSMUST00000196442 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Trem1Q9JKE2 Ccnt1-201ENSMUST00000012104 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Trem1Q9JKE2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Trem1Q9JKE2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Trem1Q9JKE2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Trem1Q9JKE2 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Siglech-201ENSMUST00000060416 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Trem1Q9JKE2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Trem1Q9JKE2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Trem1Q9JKE2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Sfi1-201ENSMUST00000066391 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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