Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cmtm7Q9ESD6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms