Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm34099-201ENSMUST00000211592 704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Kcnn1Q9EQR3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Scgb2b26-201ENSMUST00000085623 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnn1Q9EQR3 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms