Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms