Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zbed3Q9D0L1 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zbed3Q9D0L1 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zbed3Q9D0L1 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zbed3Q9D0L1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zbed3Q9D0L1 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms