Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 AC117245.4-202ENSMUST00000214403 3816 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Rmdn2-201ENSMUST00000040368 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Epn2-213ENSMUST00000179936 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms