Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Use1Q9CQ56 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Use1Q9CQ56 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
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Use1Q9CQ56 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms