Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup155Q99P88 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms